Umožňuje to memorandum o porozumení medzi SR a ČR, zastúpenými Ministerstvom výstavby a regionálneho rozvoja SR a Ministerstvom pro místní rozvoj ČR, ktorých zástupcovia právny dokument na roky 2004 až 2006 podpísali dnes v Skalici na Slovensku. Memorandum vymedzuje práva a povinnosti implementačných orgánov ako aj organizačné štruktúry pre realizáciu programu INTERREG. Funkciu riadiaceho orgánu bude vykonávať rezort výstavby a bude plniť úlohy v súlade s nariadeniami, ktoré sa vzťahujú na eurofondy. Zároveň ČR poverila rezort pre miestny rozvoj zodpovednosťou za efektivitu a správnosť riadenia a implementáciu programu. Spolupráca riadiaceho a platobného orgánu v každom štáte pôsobí separátne.

Oba rezorty financií budú platobným orgánom na území štátu a budú zodpovedať za priebeh platieb. Rezort financií ČR získal funkciu subplatobného orgánu, bude teda riadiť toky peňazí z Európskeho fondu pre regionálny rozvoj (ERDF) na svojom území. Kontrolu finančných tokov bude vykonávať v snahe predchádzať nadmerným transakčným nákladom pri vyplácaní podpôr konečným príjemcom finančnej pomoci v ČR pri realizácii projektov v rámci INTERREG. Partneri budú kontrolovať prostriedky v každej krajine zvlášť. Platobný orgán nesie zodpovednosť za finančné riadenie konkrétneho programu, subplatobný orgán za finančné riadenie na svojom území. Implementáciu programu po administratívnej stránke bude zastrešovať Spoločný technický sekretariát so sídlom v Bratislave.

Spoločný monitorovací výbor bude v mene SR a ČR zodpovedný za dohľad a monitoring implementácie programu a spoločný riadiaci výbor za výber projektov. Po nabehnutí zálohovej platby z ERDF, priebežných platieb a platby konečného zostatku z EK, platobný orgán prevedie prostriedky zodpovedajúce podielu ČR na účet subplatobného orgánu. Platba konečného zostatku, ktorá bude vyplatená EK, bude predfinancovaná z národných rozpočtov zúčastnených členských štátov.

Stránka eufondy.org využíva agentúrne spravodajstvo TASR. Publikovanie alebo dalšie šírenie obsahu týchto správ je bez predchádzajúceho písomného súhlasu TASR výslovne zakázané.